研究所聘请9位著名学者组成学术委员会，指导本所的科学研究。
    主席：
    楼宇烈：北京大学哲学系宗教学系教授，宗教研究所所长，博士生导师，教育部社科委委员，中国宗教学会顾问
    委员：
    方立天：中国人民大学佛教与宗教学理论研究所所长，哲学院宗教学系指导教授，博士生导师，教育部社科委委员，中国宗教学会顾问，中国哲学史学会常务副会长
    牟钟鉴：中央民族大学哲学与宗教学系教授，博士生导师，中国宗教学会副会长
    杨曾文：中国社会科学院荣誉学部委员，世界宗教研究所研究员，中国佛教文化研究所所长，博士生导师，中国宗教学会名誉理事
    卓新平：中国社会科学院学部委员，世界宗教研究所所长，研究员，博士生导师，中国宗教学会会长
    赵敦华：北京大学哲学系宗教学系主任，教授，博士生导师，教育部哲学学科教学指导委员会委员，中国宗教学会副会长
    何光沪：中国人民大学佛教与宗教学理论研究所专职研究员，哲学院宗教学系教授，博士生导师，中国宗教学会理事
    王邦维：北京大学东方文化研究院院长，教授，博士生导师，中国宗教学会理事
    王晓朝：清华大学哲学系教授，博士生导师，中国宗教学会理事